Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HDAC1Q13547 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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