Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TOP3AQ13472 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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