Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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