Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms