Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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