Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms