Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PSDA5PKW4 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PSDA5PKW4 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms