Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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