Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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TRIM63Q969Q1 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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TRIM63Q969Q1 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRIM63Q969Q1 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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