Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SNX29Q8TEQ0 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms