Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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RNF20Q5VTR2 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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RNF20Q5VTR2 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF20Q5VTR2 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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