Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SLC27A3Q5K4L6 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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