Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AF186192.2-204ENST00000581667 524 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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