Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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