Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SCN9AQ15858 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN9AQ15858 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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