Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCOA1Q15788 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NCOA1Q15788 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCOA1Q15788 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NCOA1Q15788 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NCOA1Q15788 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NCOA1Q15788 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NCOA1Q15788 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NCOA1Q15788 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NCOA1Q15788 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms