Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE3CQ15386 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms