Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRRQ15256 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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