Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
R3HDM1Q15032 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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