Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms