Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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