Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FHL3Q13643 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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