Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms