Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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TUBB3Q13509 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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TUBB3Q13509 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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TUBB3Q13509 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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TUBB3Q13509 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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TUBB3Q13509 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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