Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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