Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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MKRN4PQ13434 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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MKRN4PQ13434 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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MKRN4PQ13434 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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MKRN4PQ13434 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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MKRN4PQ13434 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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MKRN4PQ13434 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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MKRN4PQ13434 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
MKRN4PQ13434 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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