Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
XRCC4Q13426 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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