Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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SEMA3BQ13214 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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