Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TRDNQ13061 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TRDNQ13061 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRDNQ13061 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TRDNQ13061 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TRDNQ13061 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRDNQ13061 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRDNQ13061 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRDNQ13061 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRDNQ13061 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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