Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
BPTFQ12830 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
BPTFQ12830 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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