Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPREP23469 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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PTPREP23469 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPREP23469 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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PTPREP23469 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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PTPREP23469 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPREP23469 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPREP23469 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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