Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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