Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1Q9UJ41 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1Q9UJ41 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1Q9UJ41 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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