Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CFAP47Q6ZTR5 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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