Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SOGA3Q5TF21 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms