Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms