Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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