Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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