Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms