Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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ZIC1Q15915 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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ZIC1Q15915 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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ZIC1Q15915 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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ZIC1Q15915 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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ZIC1Q15915 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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ZIC1Q15915 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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