Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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BRD3Q15059 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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BRD3Q15059 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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BRD3Q15059 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
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BRD3Q15059 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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BRD3Q15059 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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BRD3Q15059 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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