Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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