Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms