Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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