Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PKP1Q13835 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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