Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RUNX3Q13761 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms