Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SF3B2Q13435 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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