Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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