Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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