Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
MKRN3Q13064 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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